ミッションモード

原作を再現したミッションを体感するモード。
クリアするとランクが表示され、それに応じてギルダンが手に入る。
各ミッションにはプレイするために必要な達成率が表示されている。
基本的に順々にクリアしていけば必要な達成率には到達できる。
また、各編には編ごとのすべてのミッションをクリアして初めて出現するミッションが一つ用意されている。
ターゲットの破壊や目的地を目指すタイプのミッションでは紫の矢印がマップに表示される。
途中で行き先が判らなくならないようクリア目標はちゃんと読んでおこう。

ミッションをクリアすると各ボーナスが入り、ボーナスの合計で総合評価で評価される。最終的には達成率を100%にするためにはすべてのミッションをA以上にする必要がある。

• クリアタイムボーナス・・・クリアする時間が早ければ早いほど得点が多くなる。最高5000Pts

• 被ダメージボーナス・・・キリコ合計ダメージと搭乗ATダメージに分かれており、各最高5000Ptsで合計10000Ptsが最高。キリコ合計ダメージはミッション全体を通したダメージ合計であるが、搭乗ATダメージは最後に搭乗したATのダメージとなる。またキリコでミッションクリアすると搭乗ATダメージは0.0になるが、ボーナスに含まれず、キリコ合計ダメージのみのボーナスとなる。

• 撃破ボーナス・・・AT撃破数と敵兵力撃破数に分かれている。ミッションによりATと敵兵力の数は決まっているため、ミッション内ではあまり変化はない。一部ループがあるミッションなどではより多くの撃破ボーナスがもらえるだろう。

• ミッションボーナス・・・ミッション内で実施した行動により、ボーナスが入る。

ミッションをクリアした・・・全ミッションに共通でミッションクリアで必ず入る得点。1000Pts
イベント会話が多かった・・・ 特定のイベントでイベントでの会話がある場合に入る得点。1000Pts
ATを乗り換えた・・・特定のイベントでATを乗り換えると入る得点。1000Pts
ATに乗らずにクリアした・・・キリコでクリアすると入る得点。 1000Pts
武器を拾った・・・AT・キリコで武器を拾ったときに入る得点。1000Pts
護衛対象損傷率が低かった・・・特定のミッションで護衛すべき対象物の損傷率が低い場合に出る。1000Pts
部位損傷が少なかった・・・特定のミッションでATの部位損傷が少ない場合に入る得点。1500Pts
非戦闘時間が長かった・・・特定のミッションで非戦闘時間が長い場合に入る得点。1500Pts
コンバットプログラム使用制限・・・特定のミッションでATのコンバットプログラム制限（使用不可能）がある場合に入る得点。1500Pts
首絞め成功回数が多かった・・・特定のミッションで敵を気絶させが数が多いと入る得点。2000Pts
自機ＡＴが破壊された・・・特定のミッションで自機ＡＴが破壊された場合に失う得点　-1000Pts　

• 総合評価・・・上記ボーナスの合計により以下にランク付けされる。

総合評価S・・・合計ボーナスが20000Pts以上
総合評価A・・・合計ボーナスが17500Pts以上
総合評価B・・・合計ボーナスが15000Pts以上
総合評価C・・・合計ボーナスが12500Pts以上
総合評価D ・・・合計ボーナスが12000Pts以下

■ウド編　全１６ミッション
TUTORIAL：必要達成率
終戦（チュートリアルが選択可能）：000%

STORY MISSION：必要達成率
バトリング：000%
取引：002%
レッド・ショルダー：004%
絆：006%

FREE MISSION：必要達成率
ブロウバトル：000%
リアルバトル：000%
罠：004%
襲撃：005%
陽動：002%
帰還：010%
偵察：008%
逆襲：004%
頂上：015%
フィアナ：025%
脱出：030%

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■クメン編　全１３ミッション
STORY MISSION：必要達成率
アッセンブルEX-10：008%
遡行：012%
暗転：016%

FREE MISSION:
疑惑：012%
応戦：014%
奪取：016%
掃討：016%
横断：018%
触発：020%
錯綜：020%
補給物資：020%
血路：025%
惨劇

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■サンサ編　全９ミッション
STORY MISSION:
対決
恩讐
パーフェクト・ソルジャー

FREE MISSION:
結束
ターゲット
死線
死守
激闘
孤影

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■クエント編　全６ミッション
STORY MISSION:
修羅
流星

FREE MISSION:
砂漠
生命線
連合軍殲滅
羅刹

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■EXミッション(流星をクリアすると出現)
ザ・ラストレッドショルダー
ビッグバトル
野望のルーツ
赫奕たる異端
ペールゼン・ファイルズ

ベルゼルガ物語(バトリングを通算50～100勝？)