| 駅名 | 読み | 乗換 | 備考 |
| 青森駅 | あおもり | JR東北本線・奥羽本線・津軽線・津軽海峡線 | ここから北海道鉄道の管轄区間 |
| 津軽宮田駅 | つがるみやた | ||
| 中沢駅 | なかざわ | ||
| 郷沢駅 | さとざわ | ||
| 蟹田駅 | かにた | ||
| 中小田駅 | なかおだ | ||
| 竜飛海底駅 | たっぴかいてい | ||
| 吉岡海底駅 | よしおかかいてい | ||
| 木古内駅 | きこない | ||
| 釜谷駅 | かまたに | ||
| 上磯駅 | うわいそ | ||
| 七里浜駅 | しちりはま | ||
| 函館駅 | はこだて | ||
| 七飯駅 | しちめし | ||
| 大沼駅 | おおぬま | ||
| 東山駅 | ひがしやま | ||
| 森駅 | もり | ||
| 石谷駅 | いしたに | ||
| 野田生駅 | のだなま | ||
| 八雲駅 | やぐも | ||
| 北豊津駅 | きたとよつ | ||
| 長万部駅 | おしゃべ | ||
| 目名駅 | めな | ||
| 昆布駅 | こんぶ | ||
| ニセコ駅 | にせこ | ||
| 倶知安駅 | くっちゃん | ||
| 小沢駅 | おざわ | ||
| 仁木駅 | にき | ||
| 小樽駅 | おたる | ||
| 小樽築港駅 | おたるちっこう | ||
| 稲積公園駅 | いなつみこうえん | ||
| 発寒駅 | はっかん | ||
| 桑園駅 | くわその | ||
| 札幌駅 | さっぽろ | 支線・JR線 | |
| 旭川 | あさひかわ | ここから凍結予定線 | |
| 帯広 | おびひろ | ||
| 釧路 | くしろ | ||
| 根室 | ねむろ |
| 駅名 | 読み | 乗換 | 備考 |
| 蟹田駅 | かにた | ||
| 津軽二股駅 | つがるふたまた | ||
| 今別駅 | いまべつ | ||
| 津軽浜名駅 | つがるはまな |
| 駅名 | 読み | 乗換 | 備考 |
| 札幌駅 | さっぽろ | 北海道本線・JR線 | |
| 新琴似駅 | しんことに | ||
| 百合が原駅 | ゆりがはら | ||
| あいの里教育大駅 | あいのざときょういくだい | ||
| 石狩当別駅 | いしかりとうべつ | ||
| 北海道医療大学駅 | ほっかいどういりょうだいがく | ||
| 中小屋駅 | なかこや | ||
| 石狩月形駅 | いしかりつきがた | ||
| 晩生内駅 | ばんせいない | ||
| 鶴沼駅 | つるぬま | ||
| 新徳富駅 | しんとくとみ | ||
| 新十津川駅 | しんとつかわ | ||
| 石狩沼田駅 | いしかりぬまた | ||
| 峠下駅 | とうげした | ||
| 藤山駅 | ふじやま | ||
| 留萌駅 | るりもえ | ||
| 西天塩川駅 | にしてんじおがわ | ||
| 天塩川温泉駅 | てんじおがわおんせん | ||
| 咲来駅 | さきらい | ||
| 佐久駅 | さく | ||
| 天塩中川駅 | てんじおなかがわ | ||
| 問寒別駅 | もんかんべつ | ||
| 安牛駅 | やすぎゅう | ||
| 帆延駅 | ほのび | ||
| 兜沼駅 | かぶとぬま | ||
| 稚内駅 | わっかない | ||
| 林駅 | はやし | 山北鉄道山北線 | そこから山北鉄道に乗り入れする |
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